En base a los estudios de Plan Masa se define cuatro zonas de usos principales para las diferentes actividades que se realizaran en la ZEDE - QUITO:.
a) Zona de Acogida, ubicada hacia el lindero Sur del Lote donde se establecen espacios para centro de negocios y servicios, Centro de Interpretación y Memoria Histórica, Patio de comidas, Guardería Infantil, Centro Médico, Paradas de Taxis y Buses, Plaza.
b) Zona de filtro, cerca de la zona de acogida, donde se ubican los acceso y Control de ingreso de peatones y vehículos al Área de Uso Exclusivo. Seguridad Interna de ZEDE–Quito.
c) Zona ZEDE, lugar donde se desarrollan las empresas manufactureras y logísticas, Centros I+D+i, Estacionamientos comunales, Centralidades, Servicios de Movilidad, Compostera e Infraestructura de apoyo al sistema de reutilización de aguas grises y negras tratadas, y aguas lluvias.
d) Zona de Protección Ecológica (afectaciones y restricciones), área que gestionara el cuidado ambiental de los lugares cercanos a ZEDE-QUITO.
Se prevé espacios para protección ecológica, hacia la quebrada Santa Rosa, Restricción por normativa DGAC, hacia el lindero occidental, colindante con el AIMS, Protección Arqueológica, Áreas verdes y Áreas verdes próximas a los linderos en las que no se puede edificar y aquellas que quedan como remanentes de los diseños viales.
El 09 de mayo de 2019, se emitió la Ordenanza de Proyecto Urbanístico Arquitectónico Especial de la Zona Especial de Desarrollo Económico (PUAE-ZEDE Quito), otorgando la calificación de uso de suelo del tipo Industrial 3, múltiple y equipamiento.